Ganymede sẽ được sử dụng như một thiết bị phát hiện vật chất tối Nhà vật lý William DeRocco từ Đại học Maryland đã đề xuất sử dụng mặt trăng lớn nhất của Sao Mộc như một thiết bị phát hiện vật chất tối tự nhiên trong vũ trụ. Nhà khoa học tin rằng các hạt vật chất tối khổng lồ có thể va chạm với bề mặt của nó và xuyên qua một lớp băng dày, để lại những hố va chạm bất thường. Những hố va chạm này có thể chứa khoáng chất từ đại dương ngầm của Ganymede, được đưa lên bề mặt bởi những cú va chạm như vậy. Vì vật chất tối chiếm khoảng 85% khối lượng của Vũ trụ, nhưng vẫn vô hình và gần như khó nắm bắt, nên phương pháp này có thể cung cấp một cách hoàn toàn mới để tìm kiếm nó. Theo giả thuyết của DeRocco, các cú va chạm của hạt có thể tạo ra các cột băng tan chảy có thể được phát hiện bằng các radar xuyên qua bề mặt. Các nhiệm vụ Europa Clipper của NASA và JUICE của ESA, sẽ khám phá các mặt trăng băng của Sao Mộc trong những năm tới, có thể được sử dụng để thử nghiệm ý tưởng này.